（一） 生物多样性与生态保育

主要针对海南省和环南海区域(海南岛、台湾岛、菲律宾群岛、婆罗洲、马来半岛、中南半岛等)，开展重要战略植物资源如重要作物野生近缘种、特色林木花卉等的发掘、引种与基础生物学研究。针对海南岛热带雨林、淡水湿地、珊瑚礁、红树林与城市关键海岸带等，揭示生物多样性形成与维持机制、解析关键生态过程、开展退化生态系统恢复研究，优化与提升重要生态系统的生态服务功能等，保障和提升海南省生态安全。

（二） 环南海区域生态安全

针对海南省地处中国大陆与东南亚的中间地带、位于中国南方生态屏障前沿及“一带一路”关键节点等特点，利用集中引进环南海区域海智专家的基础，从海南岛、南海岛礁、粤港澳大湾区、环南海区域等不同尺度开展海南岛生态安全及关键生态系统生态服务功能优化与提升、区域环境安全与生态文明建设等合作研究与交流，为海南热带雨林国家公园、国家生态文明试验区等“三区一中心”建设保驾护航。

（三） 传统生态文化与当代生态文明建设

发掘海南省及环南海区域的优秀生态文化，特别是入选国家级文化遗产与非物质文化遗产如洋浦千年古盐田晒盐技艺、琼中山兰稻作文化系统，以及有望申报农业文化遗产的木棉-梯田耕作体系、五指山牙胡梯田耕作体系等，从现代科学理论与技术角度，揭示其生物学基础与生态学原理，实现“把论文写在海南大地上”。同时，探索传统生态文化的现存价值及其在当代社会中的传承与利用途径，提升海南地方民族及中华民族的文化自信、民族自信，通过生态文化和环境美化两个维度丰富生态文明建设内涵，打造国家生态文明试验区的“海南样板”。